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阿奎纳相信“任何能使人类认清真理的智慧都是由上帝所先行赋予的”。不过，他也相信人类天生便有能力在没有上帝启示的帮助下了解到许多知识，即使这种知识一直被启示亦然，“尤其是与信仰有关的事物上”[6]。阿奎纳属于亚里士多德学派、以及经验主义者，他也大为影响了之后这两个学派在西方哲学界的发展。阿奎纳相信上帝所给予人类的启示可以分为两种：一般的启示以及特别的启示[7]。一般的启示可以透过观察上帝创造的自然秩序而获得，这样的观察可以透过逻辑思考而获得重要的结论，例如认知到上帝的存在。阿奎纳也曾提出一个知名的“五个证明的方法”（Five Ways），用五个例子来证明上帝的存在。
虽然人可以透过对一般启示的逻辑思考认知到上帝的存在、以及一些与上帝有关的事物，但有一些其他知识必须是要透过特别的启示才能得知的。在阿奎纳来看，耶稣基督显示了上帝的存在便是特别的启示之一。而许多基督教的重要神学基础，例如三位一体的概念，也都需要透过教会和经籍的传播才能得知，而不能只透过逻辑思考获得。
在本质上，一般的启示和特别的启示其实是可以互相补充的，而不是互相对立的。 -
阿奎纳哲学的重要架构之一是有关逻辑类比的理论。阿奎纳注意到语言的描绘可以有不同的形式：单义的、类比的、和模棱两可的[8]。单义的词汇是用以形容两个基本上一样的事物。模棱两可的词汇则是用以形容两个并不相同的东西，并且属于逻辑上的谬误。而类比则是用以形容有一些相同特征、但又非完全相同的事物。当谈到上帝时一定会用到类比法，因为一些上帝创造的事物是被隐藏起来的（Deus absconditus）、而其他则是被显现出来以让人类观察的（Deus revelatus）。阿奎纳认为我们可以透过上帝所透露的事物（一般的启示）了解到祂的存在，但只能够过类比的方法这样做。当我们谈到上帝的美德时，我们只能了解到那些在人类来看类似于上帝的美德的事物，但这些并不完全等同于上帝真正的美德[9]。 -
阿奎纳的伦理学是根基于他所谓“行为的第一原则”之上的[10]。在《神学大全》中他这样解释道：
美德代表了一些权力的运用。虽然人们是以结果来评价一件行动的是非，然而权力的结果只是行动而已。因此如果说权力是完美的，这也必须要取决于其行动才行。[11]
阿奎纳将审慎、节制、正义、以及坚忍列为人类的四大美德。这四大美德都是自然而与生俱来的，而且它们之间是互相连结的。不过，阿奎纳也指出三大神学上的美德：信仰、希望、以及慈善。这三大神学美德是超自然的，而且在他们的目标也与其他美德不同：上帝
神学美德的目标是上帝本身，上帝是所有事物的尽头，超越了我们的理性所能取得的知识。在另一方面，智慧和道德的目标则可以为人类理性所理解。神学美德也因此与道德和智慧相当不同。[12]
除此之外，阿奎纳将法则分为四大项：永恒的、自然的、人类的、和神授的。永恒的法是上帝治理所有生物的根据，自然的法是人类在永恒法则中的“参与”部分、并且可以透过理性得知[13]。自然法也是根基于他的“行为的第一原则”上：
…所有法的基本原则是：美德要被促展并行使、邪恶要被避免。所有其他自然法的原则都是根基于此。[14]
而生存和繁殖的欲望则被阿奎纳视为是基本（自然的）人类价值观的基础，所有人类的价值观都是由此衍生。人类的法则是属于实际法，只能套用至人类。而自然法则可以套用至政府和社会上。神授法则是上帝透过经籍给予的启示。
阿奎纳否认人类对于动物负有任何慈善的责任，因为动物并不属于人类，否则以它们为食也是非法的了。不过这并不表示我们有权利虐待它们，因为“残忍的习惯可能会影响我们对待其他人类的方式。 -
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阿奎纳认为上帝的存在并非可以不证自明的，但却也不是无法证明的。在《神学大全》中他提出了证明上帝存在的五个证据，这个理论又常被称为“五个证明的方法”（quinquae viae）。
在讨论到上帝的本质时，阿奎纳认为证明上帝的最好方法，便是先排除那些不可能是上帝的东西，这个方法又常被称为否定神学。他提出了五个上帝可能拥有的属性[16]：
上帝是简单的，并没有各种组成的部位，例如身体或灵魂、或者物质和形式。
上帝是完美的、毫无破绽的。亦即，上帝与其他事物的差异便在于完美无暇这个特征上。
上帝是无限的。亦即，上帝并没有如其他事物一般有着实体上的、智慧上的、或情绪上的限制。但这个无限与体积或数量上的无限并不相同。
上帝是永远不变的，上帝的本质和特征是无法改变的。
上帝是一致的，上帝自己并没有多样的特征存在。上帝的一致性本质就如同上帝的存在一般。如阿奎纳所说的：“‘上帝存在’这段命题必然是真的，其主题和结论皆为如此。”
阿奎纳的这个证明方式也是来自于其他许多之前的思想家，如犹太哲学家迈蒙尼德（Maimonides）[ -
三位一体的本质
阿奎纳主张上帝是完美又完整的，而且也可以以三位一体概念完整解释。这三个不同的位格（圣父、圣子、圣灵）由他们与上帝的联系所构成一体。圣父借由自我意识的联系产生圣子，而圣子接着又产生永恒的圣灵，圣灵“拥有神授的爱戴上帝、爱戴圣天父的本质。”
三位一体的存在并不与现实世界分割，相反的，三位一体的存在便是用于传递上帝的启示以及美德给人类。而这种传递则是透过化身而成的耶稣基督以及透过内心的圣灵（三位一体本身的精髓），并且由那些有被上帝救赎经验的人所进行
耶稣基督的本质
在《神学大全》里，阿奎纳也讨论到了耶稣基督，他首先讲述了圣经里亚当和夏娃的故事，并且描述人类原罪的负面结果。耶稣基督化身的目的是为了恢复人类的本质，协助人类移除他们身上“原罪的污染”。“神圣的智慧认为上帝应该化身为人，以这个单一而相同的化身改变人们并且提供救赎。”[19]
阿奎纳也批评了当时许多对耶稣基督抱持不同观点的历史神学家。在回复异教徒Photinus时，阿奎纳指出耶稣是真的出自神授的，而不只是一个凡人。另一个异教者聂斯脱里认为上帝只不过是寄居了耶稣的肉身，阿奎纳则回复道上帝的完整乃是耶稣的存在所不可或缺的一部分。不过，阿奎纳也曾主张耶稣具有一个真正的（理性的）人类灵魂。这个说法使得耶稣有了双重的本质，也使阿奎纳与阿利乌的理论产生矛盾。阿奎纳也反驳了欧迪奇所提出的双重本质在化身耶稣结束后依然存在的主张。阿奎纳认为这两个本质是同时存在的，但在同一个人类躯体里却是可以清楚辨别的，这个说法也与摩尼等人的理论产生差异[20]。
简而言之，“基督有一个与我们相同本质的真实躯体、一个真实的理性灵魂，但除此之外还多出了完美的神性。”也因此，耶稣基督是统一的（三位一体）、但也可以是多重的（两个本质、肉身和神性的理论）。 -
人类生命的目标
在阿奎纳来看，人类存在的目标是要与上帝结合并且建立永恒的连结。更具体的说，这个目标可以透过“乐福直观”（beatific vision）达成，乐福直观代表的是当人了解到上帝的本质，因而获得了完美、无止尽的幸福的境界。这个境界是在死后才能达成的，是由上帝给予那些在世时透过耶稣基督教诲而获得了救赎和赎罪的人的礼物。
这个最终的目标也与人在世时的作为有关。阿奎纳指出个人的意志必须被指挥朝向正确的方向，例如慈善、和平、以及神圣，他认为这是达成幸福的途径。阿奎纳以幸福的观念作为他有关道德生活的理论的轴心。意志与目标在本质上是互相联系的，因为“意志的正直可以指挥人类正确的走向最后的目标（乐福直观境界）”。那些真正试图了解并发现上帝的人也必然会爱慕上帝所爱慕之事物，这样的爱慕则需要人在每个行为的选择上坚持贯彻道德并承受结果 -
许多现代的伦理学家，包括天主教徒或非天主教徒在内，在最近以来开始主张阿奎纳的美德伦理概念可能可以用作取代康德的功利主义学派。透过许多20世纪的哲学家，例如伊利莎白·安司孔（Elizabeth Anscombe）等人的著作，阿奎纳在有关行为意图的理论上也变的相当具影响力。
值得注意的是阿奎纳的美学理论，尤其是“明白”（claritas）的概念，极大的影响了现代作家詹姆斯·乔伊斯的文学风格，乔伊斯赞美阿奎纳是西方哲学里排名第二的哲学家，仅次于亚里士多德。阿奎纳的美学概念的影响也可以在意大利符号学家翁贝托·埃可的作品里观察到，埃可也写了一篇有关阿奎纳的美学概念的论文。
数个世纪以来有许多阿奎纳的传记被出版，其中最知名的是由却斯特顿写成。
作品
哲学大全
神学大全
